Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA5

SUCNR1, Succinate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCNR1Q9BXA5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SUCNR1Q9BXA5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SUCNR1Q9BXA5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SUCNR1Q9BXA5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUCNR1Q9BXA5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUCNR1Q9BXA5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SUCNR1Q9BXA5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUCNR1Q9BXA5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms