Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PI4K2AQ9BTU6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PI4K2AQ9BTU6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PI4K2AQ9BTU6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PI4K2AQ9BTU6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PI4K2AQ9BTU6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4K2AQ9BTU6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 774.6 ms