Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYT11Q9BT88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYT11Q9BT88 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYT11Q9BT88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYT11Q9BT88 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYT11Q9BT88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYT11Q9BT88 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms