Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NICN1Q9BSH3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NICN1Q9BSH3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NICN1Q9BSH3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NICN1Q9BSH3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NICN1Q9BSH3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NICN1Q9BSH3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NICN1Q9BSH3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms