Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GORASP1Q9BQQ3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GORASP1Q9BQQ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GORASP1Q9BQQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GORASP1Q9BQQ3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GORASP1Q9BQQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms