Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TREX2Q9BQ50 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TREX2Q9BQ50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TREX2Q9BQ50 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TREX2Q9BQ50 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TREX2Q9BQ50 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TREX2Q9BQ50 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms