Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RETNLBQ9BQ08 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RETNLBQ9BQ08 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RETNLBQ9BQ08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RETNLBQ9BQ08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms