Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UHRF1Q96T88 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UHRF1Q96T88 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UHRF1Q96T88 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UHRF1Q96T88 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UHRF1Q96T88 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UHRF1Q96T88 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UHRF1Q96T88 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UHRF1Q96T88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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