Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
IFT140Q96RY7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
IFT140Q96RY7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
IFT140Q96RY7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
IFT140Q96RY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
IFT140Q96RY7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
IFT140Q96RY7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
IFT140Q96RY7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
IFT140Q96RY7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
IFT140Q96RY7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC45.25■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
IFT140Q96RY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
IFT140Q96RY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
IFT140Q96RY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
IFT140Q96RY7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
IFT140Q96RY7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
IFT140Q96RY7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
IFT140Q96RY7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
IFT140Q96RY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
IFT140Q96RY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
IFT140Q96RY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
IFT140Q96RY7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
IFT140Q96RY7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
IFT140Q96RY7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
IFT140Q96RY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.9■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.88■■■■■ 4.78
IFT140Q96RY7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.87■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
IFT140Q96RY7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
IFT140Q96RY7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
IFT140Q96RY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
IFT140Q96RY7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
IFT140Q96RY7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.69■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.64■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.63■■■■■ 4.74
IFT140Q96RY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
IFT140Q96RY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms