Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GAL3ST4Q96RP7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GAL3ST4Q96RP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GAL3ST4Q96RP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAL3ST4Q96RP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAL3ST4Q96RP7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAL3ST4Q96RP7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms