Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCNAQ96QF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCNAQ96QF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GCNAQ96QF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GCNAQ96QF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GCNAQ96QF7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GCNAQ96QF7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GCNAQ96QF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms