Protein–RNA interactions for Protein: Q96QA5

GSDMA, Gasdermin-A, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMAQ96QA5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GSDMAQ96QA5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GSDMAQ96QA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GSDMAQ96QA5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GSDMAQ96QA5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GSDMAQ96QA5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GSDMAQ96QA5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GSDMAQ96QA5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GSDMAQ96QA5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMAQ96QA5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMAQ96QA5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GSDMAQ96QA5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms