Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SORCS2Q96PQ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SORCS2Q96PQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORCS2Q96PQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SORCS2Q96PQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORCS2Q96PQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms