Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CCDC7Q96M83 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CCDC7Q96M83 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CCDC7Q96M83 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
CCDC7Q96M83 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CCDC7Q96M83 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CCDC7Q96M83 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms