Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PKNOX2Q96KN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PKNOX2Q96KN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PKNOX2Q96KN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PKNOX2Q96KN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKNOX2Q96KN3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms