Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPTM1LQ96KA5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPTM1LQ96KA5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPTM1LQ96KA5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPTM1LQ96KA5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPTM1LQ96KA5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPTM1LQ96KA5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLPTM1LQ96KA5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLPTM1LQ96KA5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLPTM1LQ96KA5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLPTM1LQ96KA5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLPTM1LQ96KA5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms