Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLC35E1Q96K37 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC35E1Q96K37 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC35E1Q96K37 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35E1Q96K37 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms