Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BORCS6Q96GS4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BORCS6Q96GS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BORCS6Q96GS4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BORCS6Q96GS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BORCS6Q96GS4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BORCS6Q96GS4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms