Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OTUB1Q96FW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUB1Q96FW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUB1Q96FW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
OTUB1Q96FW1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OTUB1Q96FW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OTUB1Q96FW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms