Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3CQ96E17 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3CQ96E17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB3CQ96E17 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3CQ96E17 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3CQ96E17 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms