Protein–RNA interactions for Protein: Q96C01

FAM136A, Protein FAM136A, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM136AQ96C01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FAM136AQ96C01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM136AQ96C01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM136AQ96C01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM136AQ96C01 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM136AQ96C01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM136AQ96C01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms