Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NELL1Q92832 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NELL1Q92832 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NELL1Q92832 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NELL1Q92832 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NELL1Q92832 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NELL1Q92832 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NELL1Q92832 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELL1Q92832 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELL1Q92832 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NELL1Q92832 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms