Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPGAT1Q92604 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPGAT1Q92604 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPGAT1Q92604 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LPGAT1Q92604 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LPGAT1Q92604 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LPGAT1Q92604 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LPGAT1Q92604 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LPGAT1Q92604 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPGAT1Q92604 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms