Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX19Q92543 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX19Q92543 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX19Q92543 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX19Q92543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX19Q92543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms