Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GATAD2BQ8WXI9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATAD2BQ8WXI9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATAD2BQ8WXI9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GATAD2BQ8WXI9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATAD2BQ8WXI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms