Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB40AQ8WXH6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB40AQ8WXH6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB40AQ8WXH6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB40AQ8WXH6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB40AQ8WXH6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms