Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A1Q8WWI5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A1Q8WWI5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC44A1Q8WWI5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC44A1Q8WWI5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC44A1Q8WWI5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC44A1Q8WWI5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms