Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAT3Q8TDW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAT3Q8TDW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAT3Q8TDW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FAT3Q8TDW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT3Q8TDW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT3Q8TDW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAT3Q8TDW7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT3Q8TDW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAT3Q8TDW7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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