Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HAVCR2Q8TDQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HAVCR2Q8TDQ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HAVCR2Q8TDQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HAVCR2Q8TDQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HAVCR2Q8TDQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms