Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN5Q8TD22 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFXN5Q8TD22 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFXN5Q8TD22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFXN5Q8TD22 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFXN5Q8TD22 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFXN5Q8TD22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms