Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
COL22A1Q8NFW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
COL22A1Q8NFW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
COL22A1Q8NFW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
COL22A1Q8NFW1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
COL22A1Q8NFW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
COL22A1Q8NFW1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
COL22A1Q8NFW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
COL22A1Q8NFW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
COL22A1Q8NFW1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
COL22A1Q8NFW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
COL22A1Q8NFW1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
COL22A1Q8NFW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
COL22A1Q8NFW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
COL22A1Q8NFW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
COL22A1Q8NFW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
COL22A1Q8NFW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
COL22A1Q8NFW1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms