Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSNK2A3Q8NEV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2A3Q8NEV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2A3Q8NEV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms