Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BMPERQ8N8U9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMPERQ8N8U9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMPERQ8N8U9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMPERQ8N8U9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BMPERQ8N8U9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMPERQ8N8U9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms