Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2J2Q8N2K1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2J2Q8N2K1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBE2J2Q8N2K1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2J2Q8N2K1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2J2Q8N2K1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms