Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC116Q8IYX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC116Q8IYX3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC116Q8IYX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC116Q8IYX3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC116Q8IYX3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms