Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAPLN4Q86UW8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAPLN4Q86UW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HAPLN4Q86UW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HAPLN4Q86UW8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HAPLN4Q86UW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HAPLN4Q86UW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms