Protein–RNA interactions for Protein: Q86SQ9

DHDDS, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit DHDDS, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHDDSQ86SQ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHDDSQ86SQ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DHDDSQ86SQ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHDDSQ86SQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DHDDSQ86SQ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DHDDSQ86SQ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DHDDSQ86SQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms