Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM46Q7Z4K8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM46Q7Z4K8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM46Q7Z4K8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM46Q7Z4K8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM46Q7Z4K8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM46Q7Z4K8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRIM46Q7Z4K8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM46Q7Z4K8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms