Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC29A4Q7RTT9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC29A4Q7RTT9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC29A4Q7RTT9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC29A4Q7RTT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC29A4Q7RTT9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC29A4Q7RTT9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms