Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX6Q7RTT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX6Q7RTT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSX6Q7RTT6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSX6Q7RTT6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSX6Q7RTT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSX6Q7RTT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SSX6Q7RTT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX6Q7RTT6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSX6Q7RTT6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX6Q7RTT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSX6Q7RTT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSX6Q7RTT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms