Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SSX7Q7RTT5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SSX7Q7RTT5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX7Q7RTT5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSX7Q7RTT5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX7Q7RTT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX7Q7RTT5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms