Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM47EQ6ZV65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM47EQ6ZV65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47EQ6ZV65 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47EQ6ZV65 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47EQ6ZV65 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47EQ6ZV65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms