Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP47Q6ZTR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFAP47Q6ZTR5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP47Q6ZTR5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFAP47Q6ZTR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFAP47Q6ZTR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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