Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMEM136Q6ZRR5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMEM136Q6ZRR5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM136Q6ZRR5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM136Q6ZRR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM136Q6ZRR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms