Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP77Q6ZQR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CFAP77Q6ZQR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFAP77Q6ZQR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CFAP77Q6ZQR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms