Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
THSD4Q6ZMP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
THSD4Q6ZMP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THSD4Q6ZMP0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THSD4Q6ZMP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
THSD4Q6ZMP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
THSD4Q6ZMP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms