Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDZRN4Q6ZMN7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDZRN4Q6ZMN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDZRN4Q6ZMN7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDZRN4Q6ZMN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDZRN4Q6ZMN7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms