Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CD109Q6YHK3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CD109Q6YHK3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CD109Q6YHK3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CD109Q6YHK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CD109Q6YHK3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CD109Q6YHK3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CD109Q6YHK3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CD109Q6YHK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.23
CD109Q6YHK3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CD109Q6YHK3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CD109Q6YHK3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CD109Q6YHK3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CD109Q6YHK3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
CD109Q6YHK3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CD109Q6YHK3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CD109Q6YHK3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CD109Q6YHK3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CD109Q6YHK3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CD109Q6YHK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CD109Q6YHK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CD109Q6YHK3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CD109Q6YHK3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms