Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNT2Q6UVM3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNT2Q6UVM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNT2Q6UVM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNT2Q6UVM3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNT2Q6UVM3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms