Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ZBED9Q6R2W3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ZBED9Q6R2W3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZBED9Q6R2W3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ZBED9Q6R2W3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ZBED9Q6R2W3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ZBED9Q6R2W3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZBED9Q6R2W3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZBED9Q6R2W3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZBED9Q6R2W3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZBED9Q6R2W3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZBED9Q6R2W3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZBED9Q6R2W3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZBED9Q6R2W3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZBED9Q6R2W3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms